Το κόστος λειτουργίας του ΠΜΣ καλύπτεται κυρίως από τα τέλη φοίτησης .

Τα τέλη φοίτησης ανέρχονται στο ποσό των 3000 ευρώ και επιμερίζονται σε τρείς ισόποσες δόσεις των 1000 ευρώ. Η πρώτη καταβάλλεται με την εγγραφή στο Μεταπτυχιακό πρόγραμμα. Η δεύτερη στο μέσον του 1ου εξαμήνου σε ημερομηνία που ορίζεται και η τρίτη στην αρχή του 2ου εξαμήνου. Εάν η καταβολή των τελών φοίτησης γίνει εφάπαξ τότε υπάρχει 10% έκπτωση και καταβάλλονται με την εγγραφή 2700 ευρώ.
Μέρος των εσόδων από το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών θα χρησιμοποιείται για την προμήθεια εποπτικών μέσων διδασκαλίας, εύκολη και ταχεία πρόσβαση στο διαδίκτυο, εκπαιδευτικό υλικό (σημειώσεις βιβλία, κ.ά.)
Επίσης θα καλύπτεται αγορά και τοποθέτηση Λογισμικού που θα εξυπηρετεί τις ανάγκες του ΠΜΣ, τεχνική υποστήριξη, και δαπάνες αναλωσίμων. Επιπλέον θα καλύπτονται δαπάνες δημοσιότητας και διάχυσης αποτελεσμάτων, επιστημονικής έρευνας, πρακτικής άσκησης, οργάνωση επιστημονικών εκδηλώσεων παροχή σεμιναρίων που αφορούν την κατάρτιση των μεταπτυχιακών φοιτητών του προγράμματος κλπ.

Ιδιαίτερη έμφαση δίνεται στην οικονομική υποστήριξη της εκπαίδευσης από τακτικό αλλά και έκτακτο Διδακτικό προσωπικό, που συμμετέχει στις εκπαιδευτικές και οργανωτικές διαδικασίες του ΠΜΣ.

Υποτροφίες θα παρέχονται σε ποσοστό μέχρι 30% του συνολικού αριθμού των φοιτητών του ΠΜΣ με κριτήριο αξιολόγησης το εισόδημα, συγκεκριμένα το ατομικό δεν θα πρέπει να υπερβαίνει το εκατό τοις εκατό (100%), ενώ το οικογενειακό εισόδημα το εβδομήντα τοις εκατό (70%) του εθνικού διάμεσου ισοδύναμου εισοδήματος.